元至元二十九年(1292年)上海县立,同心村地区属长人乡,在十六保。
明嘉靖年间至民国,为十六保二十八图。
1950年,同心村地区有22个宅基,分别隶属于邻松乡荷溪村(今同心村第一、第二村民小组)、高阳村(今同心村第三、第四、第五、第六、第七村民小组)、曹家村(今同心村第八村民小组)。
1951年初,地区建有数十个农业生产互助组,每组有农户2—5户。入组农户的农具、耕牛等各户自备,工日多少以筹码交换。1955年,由互助组发展为初级农业生产合作社,取名同心。
1956年,成立同心高级农业生产合作社。
1958年9月,为群力人民公社成立野战大队同心中队。
1961年9月,为马桥人民公社同心大队。
1984年,改为马桥乡同心村。
1961年,大队办公室设皋阳庙,1980年迁四队工农河南。
20世纪90年代,村委会办公室先后迁荷巷桥集镇、江川路底,2001年迁汇江路195号。
1993年5月18日,上海市闵行区马桥镇同心村民委员会正式成立。