元至元二十九年（1292年）上海县立，同心村地区属长人乡，在十六保。

明嘉靖年间至民国，为十六保二十八图。

1950年，同心村地区有22个宅基，分别隶属于邻松乡荷溪村（今同心村第一、第二村民小组）、高阳村（今同心村第三、第四、第五、第六、第七村民小组）、曹家村（今同心村第八村民小组）。

1951年初，地区建有数十个农业生产互助组，每组有农户2—5户。入组农户的农具、耕牛等各户自备，工日多少以筹码交换。1955年，由互助组发展为初级农业生产合作社，取名同心。

1956年，成立同心高级农业生产合作社。

1958年9月，为群力人民公社成立野战大队同心中队。

1961年9月，为马桥人民公社同心大队。

1984年，改为马桥乡同心村。

1961年，大队办公室设皋阳庙，1980年迁四队工农河南。

20世纪90年代，村委会办公室先后迁荷巷桥集镇、江川路底，2001年迁汇江路195号。

1993年5月18日，上海市闵行区马桥镇同心村民委员会正式成立。